随着中国国产航母山东舰的服役，关于航母的话题再度沦为大家辩论的焦点。航母编队可谓地球上最强劲的登陆作战力量，航母在十几艘护航舰的维护下，需要仅次于程度充分发挥舰载机的登陆作战能力，一般的反击力量对航母编队几乎没效果。这也是世界上有能力的大国都在着力发展航母的最重要原因。
然而，许多人不告诉的是，可观的航母编队指挥部往往不出航母上面，这是怎么回事呢？很多人有可能有一个误区，那就是航母的舰长负责管理指挥官整个航母编队，实质上并非如此。以美国航母编队为事例，美国航母舰长主要负责管理指挥官航母的登陆作战和训练，主要起管理起到，一旦到了空战阶段，航母舰长连调动舰载机的权力都没。航母舰载机有专门的指挥官，只把持航母编队的最低司令官。
美国航母舰长一般只有上校军衔，而航母战斗群司令则多是少将或准将军衔，这就很解释问题了。所以在航母编队指挥部的自由选择上，大部分情况下都会将其成立在航母上面，而是有专门的“旗舰”。
航母战斗群总司令在哪艘船上指挥官，哪艘船上就不会照亮一面司令旗。法国戴高乐号航母编队的指挥舰就是航母本身，而美国航母就较为类似了，有时指挥舰在驱逐舰上，有时甚至在潜艇中。大部分情况下，美国航母都不将旗舰成立在航母上，比如知名的“蓝岭”号指挥舰。
中国也曾研发过051Z型驱逐舰，比如深圳舰，长期以来深圳舰就是南海舰队的旗舰。为什么不会经常出现这种情况呢？首先，指挥舰是航母编队的指挥官中枢，负责管理分析处置各种情报信息，预警各种有可能再次发生的危险性，确保航母编队的长时间运作。一个航母指挥部有可能要有上百人在一起工作。
将航母编队指挥部决定在指挥舰上，需要节省航母宝贵的空间，让舰岛宝贵的空间用来更佳的处置舰载机上，更佳的充分发挥航母的登陆作战能力。21世纪的航母发展趋势，是航母舰岛更加小，未来甚至有可能完全消失，因为这样才能配备更好的舰载机，让舰载机的民航机更为便利。
有人可能会说道，将航母指挥部放到航母内部敢吗？实质上，航母内部敲几张办公桌是很非常简单的，但对于航母指挥官必须的大量指挥官、通信和传感器系统，在航母上是没空间加装的。除非将舰岛规模不断扩大，但这又跟舰载机的用于构成了冲突。所以最差的解决办法，就是将航母指挥部放到某一艘驱逐舰或者潜艇上。在实际登陆作战中，我们不有可能只能寻找敌人航母编队的指挥部所在。
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